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本文标题:"生物物种水平分化通常相似为97%-微生物鉴定"

新闻来源:未知 发布时间:2018-5-3 16:39:22 本站主页地址:http://www.jiance17.com

生物物种水平分化通常相似为97%-微生物鉴定

  非培养的生物学方法

  虽然最初广泛应用非培养的磷脂脂肪酸法(PLFA)来分析环境中的菌
群类型,但如今DNA和RNA测序方法更加广泛地应用于微生物鉴定和它们
的系统发育树研究。这些方法已经用于定位和定量分析分离出的环境中
的微生物,甚至是那些能够在环境中增殖但未被实验室分离培养的微生
物。
  微生物的16S rRNA序列不仅具有高度保守的核苷酸序列,而且序列
的多样性提供了区分细菌、古菌和真核生物之间差异的方法。基于上述
多样性的水平、系统发育、基因组和物种水平上也会有差别(Ward等,1
992)。实际上,生物物种水平的分化通常相似性为97%;这是整个基因
组DNA—DNA杂交结果与16S rRNA序列相近呈现弱相关性的基础(Stackeb
randt和Goebel,1994)。在整个基因组的杂交中,16S rRNA序列大于70
%而小于97%的链相近即被认为是同种属的一部分。由于任何新生物的
16S rRNA序列一旦发现就会进入数据库,可以将新分离到的16S rRNA序
列在数据库中进行比较来确定是否已被精确报道,并鉴定亲缘关系。虽
然16S rRNA序列已被证明为可靠的系统发育标记,但还是推荐读者了解
一下Olsen和Woese写的关于高分子对比系统发育重要性的综述,既可作
为检测分子系统发育总的可靠性方法,也可作为更广泛基因组发育史的

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