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本文标题："微生物中获取出来-已知的微生物分析显微镜"
新闻来源：未知 发布时间：2018-5-9 17:15:10 本站主页地址：http://www.jiance17.com
微生物中获取出来-已知的微生物分析显微镜
位素微阵列中，放射性标记RNA(特别包括14C)从样本中提取出来并
进行荧光子标记，然后靶向识别相应的不同微生物的16S rRNA。在这种
方法中，可以摄取标记的生物可以被快速分离，不用事先了解共有的成
分(Adamczyk等，2003)。同位素微阵列是一种高通量筛选方法可以缩短
孵育时间。但是与SIP不同，同位素微阵列只能检测序列已知的微生物
，因此考虑到这点，它的限制性更强。像先前讨论中提到FISH—MAR技
术的限制是生物代谢静止(或简单慢速生长)的时候样本将会消失，而且
这项技术对放射标记的基质研究也同样受到限制。 基因组组合技术
虽然同位素标记能将特殊代谢能力和环境中的特殊微生物联系起来
，但不能了解它是整个代谢中的哪个环节。这些问题，可以用基因组推
断潜在的代谢能力或催化地质化学反应的能力来拟补。强调它是潜在的
，对基因组研究再好不过了，因为它能够暗示目标生物可能进行的代谢
。这种分析(经常称为代谢组学；Risesenfeld等，2004；DeLong，2007
)依赖繁琐的计算分析来比较每个不同序列，从而鉴定DNA基序或预测基
因产物的特殊功能。还可以推测相关一种已知蛋白可能催化的反应，或
在哪种基因的编码情况下它能够表达；有时，基因组分析甚至能应用于
整个微生物群落的活动中(Tyson等，2004；DeLong等，2006)。最终，
这些假设可能通过经典基因检测和生化分析来证明特殊基因的存在，推
断的代谢或地质化学作用(见8．4部分和Martinez等，2007)。多种方法
能够将基因组信息从特殊环境的微生物中获取出来(例如，磁电机一FIS
H，数字PCR)。因此即使细胞宿主已经丢失，如果有足够量DNA能克隆到
重装的整个基因组中，宏基因组学仍可以特定生物体获得。我们强调假
设，因为从环境DNA重建最初的基因组依旧具有很大挑战性。不仅是基
因的表达原位监测(Ram等，2005)，而且可以追踪到自然环境中特定基
因型和它们关系较近的种群(Rich等，2008)以指导培养基的设计来分离
／研究特殊地质微生物(Tysom等，2005；Sabehi等，2005)。关于地质
微生物在地质微观背景中基因组学面临的问题、机遇和挑战更全面的讨
论见Banfield等(2005)。8．3．5代谢基因的表达或它们基因产物的探
针检测
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